《三年行動方案》以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，以實現國家碳達峰碳中和目標為引領，以推動能源綠色低碳、健康持續發展為主線，確立了堅持前瞻布局、堅持系統思維、堅持創新驅動、堅持內外互動的四個工作原則；確定了以積極服務國家部委、積極服務地方各級政府、積極服務各開發企業和集團公司作為三項主要目標。
《三年行動方案》指出，水電總院要將國家碳達峰碳中和愿景目標和“碳達峰十大行動”貫穿總院業務拓展和自身能力建設，重點實施水電總院“助力能源綠色低碳轉型行動、助力區域綠色低碳發展行動、綠色低碳科技創新行動、核心能力建設提升行動、促進國際合作交流行動”等五大行動二十四項任務。
《三年行動方案》同時提出三條保障措施：一是理順工作運行機制，構建統一領導、權責對等、分工明晰、運行順暢的雙碳行動落實工作機制，重點抓落實、抓實效。二是強化績效考核機制，注重考核應用，將考核結果與提拔晉升、績效獎金、推優評先等相關聯，營造鼓勵創新、敢挑重擔的良好氛圍。三是落實資源保障機制，加強人才保障，圍繞工作開展和業務培育所需的核心能力，加強專精尖人才和綜合性人才的培養與引進。
